д-р хим. наук, заслуженный изобретатель, профессор кафедры химии Андижанского государственного университета им. З.М. Бабура, 170100, Республика Узбекистан, Андижан, Университет, дом 129
ИССЛЕДОВАНИЕ ЭЛЕКТРОННОГО СТРОЕНИЯ БИОЛОГИЧЕСКИ АКТИВНОГО ПРЕПАРАТА ФЕНИБУТ
АННОТАЦИЯ
Современным методом квантовой химии изучено электронное строение препарата Фенибут, широко применяемого при нервных расстройствах живого организма. Установление реакционной способности может помочь в изучении биологической активности.
ABSTRACT
The electronic structure of the drug Phenibut, which is widely used in nervous disorders of a living organism, has been studied by the modern method of quantum chemistry. Establishing reactivity can help in the study of biological activity.
Ключевые слова: фенибут, нервные расстройства, биологическая активность, квантово-химический расчет, метод DFT-D3LYP, геометрия молекулы, электронная структура.
Keywords: phenibut, nervous disorders, biological activity, quantum-chemical calculation, DFT-D3LYP method, geometry, electronic structure.
Объектом данного исследования является Фенибут (β-фенил-γ-аминомасляная кислота) 1, биологически активное вещество, производное γ -аминомасляной кислоты. Активен в отношении A- и B- рецепторов γ-аминомасляной кислоты, а также рецепторов фенилэтиламина [1]. Биологическая активность молекулы определяется нахождением в молекуле ароматического кольца и двух важных функциональных групп для живых организмов: карбоксильной и аминогрупп. Препарат зарегистрирован в медицинской практике как анксиолитическое и ноотропное средство; его применяют при различных нервных расстройствах, таких как беспокойство, бессонница, посттравматический стресс, депрессия, заикание и др. [1, 2].
Представляет большой теоретический интерес изучение перераспределения с высокой точностью электронных зарядов на атомах, которое обусловливает реакционную способность вещества.
Нами использован квантово-химический метод B3LYP с базисным набором 3-21G, использованный нами ранее для исследования гетероароматических систем [3-6]. В ходе расчетов все геометрические параметры молекулы были подвергнуты полной оптимизации. Полученные численные данные представлены в тысячных единицах, для удобства сопоставления и точного вывода результатов.
Ароматическая группа в оптимизированной молекуле имеет плоскую форму, о чем свидетельствуют рассчитанные торсионные углы ароматического фрагмента. На рисунке 1, показана условная нумерация и перераспределение атомных зарядов в молекуле фенибут в схематичном виде, для удобства анализа данных.
Рисунок 1. Нумерация атомов и распределение заряда на атомах в молекуле
Например, торсинные углы углеродного скелета этой группы τ(C6-C1-C2-C3), τ(C1-C2-C3-C4), τ(C2-C3-C4-C5) и τ(C4-C5-C6-C7) соответственно равны -0.116о, -0.236о, 0.059о и 0.472о; а также ароматические атомы водорода тоже лежат в этой плоскости. Их торсионные углы τ(C6-C1-C2-H), τ(C1-C2-C3-H), τ(C2-C3-C4-H), τ(C3-C4-C5-H) и (C4-C5-C6-H) соответственно равны -178.320о, 179.975о, -179.993о, -179.800ои 178.892о, которые свидетельствуют об ароматичности кольца.
Таблица 1.
Заряды на атомах, длина связей и валентные углы молекулы Фенибут
№ |
Атом |
q, e |
Длина связи |
d, Å |
Валентный угол |
φ, град. |
1 |
C1 |
-0.267 |
C1-C2 |
1.404 |
C1-C2-C3 |
120.709 |
2 |
C2 |
-0.228 |
C2-C3 |
1.398 |
C3-C4-C5 |
119.266 |
3 |
C3 |
-0.186 |
C3-C4 |
1.394 |
С5-С6-С1 |
120.708 |
4 |
C4 |
-0.188 |
C4-C5 |
1.397 |
C1-C7-C8 |
112.691 |
5 |
C5 |
-0.189 |
C5-C6 |
1.394 |
C8-C9-O10 |
126.538 |
6 |
C6 |
-0.203 |
C1-C7 |
1.538 |
C8-C9-O11 |
110.844 |
7 |
C7 |
-0.267 |
C7-C8 |
1.548 |
C7-C12-N13 |
120.920 |
8 |
C8 |
-0.469 |
C8-C9 |
1.511 |
C1-C2-H |
120.630 |
9 |
C9 |
0.645 |
C9-O10 |
1.224 |
C2-C3-H |
119.438 |
10 |
O10 |
-0.478 |
C7-C12 |
1.557 |
C5-C6-H |
121.534 |
11 |
O11 |
-0.547 |
C12-N13 |
1.482 |
C1-C7-H |
108.512 |
12 |
C12 |
-0.205 |
C2-H |
1.082 |
C7-C8-H |
108.124 |
13 |
N13 |
-0.651 |
C3-H |
1.084 |
C9-O10-H |
126.538 |
14 |
H2 |
0.192 |
C4-H |
1.084 |
C7-C12-H |
108.278 |
15 |
H3 |
0.178 |
C5-H |
1.085 |
C12-N13-H |
111.794 |
16 |
H4 |
0.178 |
C6-H |
1.084 |
|
|
17 |
H5 |
0.178 |
C7-H |
1.100 |
|
|
18 |
H6 |
0.226 |
C8-H |
1.090 |
|
|
19 |
H7 |
0.231 |
C8-H’ |
1.099 |
|
|
20 |
H8 |
0.231 |
O11-H |
0.999 |
|
|
21 |
H8’ |
0.229 |
C12-H |
1.106 |
|
|
22 |
H11 |
0.362 |
C12-H’ |
1.094 |
|
|
23 |
H12 |
0.163 |
N13-H |
1.024 |
|
|
24 |
H12’ |
0.214 |
N13-H’ |
1.023 |
|
|
25 |
H13 |
0.270 |
|
|
|
|
26 |
H13’ |
0.272 |
|
|
|
|
Согласно табличным данным, атомы кислорода O10, O11, карбоксильной группы и атом азота N13 аминогруппы несут максимальные отрицательные заряды равные -0.478е, -0.547е и -0.651е, соответственно.
ВЗМО НСМО
Рисунок 2. Граничные Орбитали (ГО) молекулы
Энергия ГО Фенибута составляет: ЕВЗМО = -0,217эВ, ЕНСМО = 0,004эВ. Энергетическая щель между ГО равна ∆ЕГО = 0, 221эВ < 1эВ. В целом, распределение зарядов (см. таблицу) и вид ГО (Рис. 2.) указывают на высокую реакционную способность реагентов в отношении к аминогруппе и карбоксильной группам, согласно зарядового и орбитального типа контроля реакций.
Список литературы:
- Matthew I. Hardman, Juraj Sprung, Toby N. Weingarten.// Bosnian Journal of Basic Medical Sciences. — 2019. — Vol. 19, No. 2. — С. 125–129.
- Аскаров И.Р., Исаев Ю.Т., Махсумов А.Г., Киргизов Ш.М. Органическая химия. / Т.: изд-во Г. Гулям. - 2012. - 608 с.
- M.J.F. Frisch and etc. / Gaussian 98. Revision A.5, Gaussian Inc.- Pittsburg (PA), 1998.
- И.Р. Аскаров, Ш.М.Киргизов, М.Х. Мамарахмонов, С.А. Алимбоев. Синтез и квантово-химическое изучение реакции ацетилферроцена с изомерами аминобензойной кислоты. / Universum: Химия и биология : электрон. научн. журн. 2020. № 1(67). Стр 42-44.
- М.Х. Мамарахмонов, Л.И. Беленький, А.М. Джураев, Н.Д. Чувылкин, И.Р. Аскаров. Квантово-химическое изучение производных ферроцена. Сообщение 1. Реакции арилирования с аминобензойными кислотами // Изв. АН. Сер. хим. – Москва, 2017. - №4. С. 721-723.
- М.Х. Мамарахмонов, Л.И. Беленький, Н.Д. Чувылкин, И.Р. Аскаров Квантово-химическое изучение производных ферроцена. Сообщение 2. Реакции арилирования с аминофенолами // Изв. АН. Сер. хим. – Москва, 2017. - №4. С. 724-726.